L’Ap ha ideato il Centro per l'Autonomia, che opera dal 1997 presso l’Azienda Usl Roma C al fine di favorire l’abilitazione e la riabilitazione delle persone con disabilità grave e gravissima e di facilitare percorsi di autonomia ed autodeterminazione. È gestito dalla cooperativa sociale Centro per l'Autonomia - Michele Iacontino (già "Emmei") e si trova presso la sede dell’Ap a Roma.